Bereits 1879 wurde die erste Funtenseehütte im Steinernen Meer errichtet. In den 146 Jahren seit dem Bestehen wurde die jetzige DAV-Schutzhütte mehrmals erweitert und wechselte zwischenzeitlich auch zwei Mal den Standort. Den aktuellen Namen Kärlingerhaus erhielt sie 1910 nach dem Sektionsvorsitzenden Kajetan Kärlinger.
Nach so vielen Jahren sind nun wieder umfangreiche Baumaßnahmen vonnöten.